Neden çoğu kısıtlama enzimi palindromik sekansta kesiliyor?

Neden çoğu kısıtlama enzimi palindromik sekansta kesiliyor?
Anonim

Cevap:

Çünkü daha verimli.

Açıklama:

Kısıtlama enzimleri gibi enzimlerin görevini yerine getirmek için çok spesifik bir diziyi tanıması gerekir. DNA'ya yalnızca belirli bir konfigürasyonda bağlanır. Neyse ki! Çünkü rastgele yerlerde DNA kesen bir 'pacman' istemiyorsunuz.

DNA çift sarmallıdır, dolayısıyla enzimin bağlanabileceği 'iki taraf' vardır. Palindromik bir sekans her iki tarafta da aynı şekilde ileri ve geri aynıdır (aşağıdaki resme bakınız). Bu, enzimin, DNA'nın hangi tarafından yaklaştığına bakılmaksızın diziyi tanıdığı anlamına gelir.

Bir palindromik dizi ayrıca, her iki DNA iplikçiliğinin kesilme şansını da arttırır. İki enzimin, palindromik sekansı kesmek için bir dimer olarak çalışması ve ayrıca verimliliği arttırması bile mümkündür.

Son sebep, virüs ve bakteri arasındaki mücadelede önemli olmuştur. Bakteriler, bu palindromik sekanslara bağlanan kısıtlama enzimlerini kullanarak bakteri hedefleyen virüsleri (bakteriyofajlar) 'devre dışı bırakmak' için gelişti. Her iki DNA şeridinin kesilmesi virüse bir iplikçik kesmekten daha fazla zarar verir.